Quando você deseja criar uma nova partição a partir da existente, a tabela de partição precisa ser reescrita. Além disso, quando você quiser reescrever uma tabela de partições, haverá um efeito no sistema de arquivos existente. Agora, como você está tentando fazer isso a partir de sua instalação existente e deseja gravar a tabela de partições na tabela de partições raiz, há um impacto na tabela de partição raiz. Então, é extremamente perigoso (algo como "$ rm -rf /"). Atualmente, o Linux é inteligente o suficiente para detectar esse tipo de confusão e para o usuário antecipadamente.
Então, o que você deve fazer é usar o Linux no modo ao vivo, usar o GParted e tentar reparticionar. Nesse momento, seu disco rígido não será sua instalação principal. Então, isso permitirá que você faça isso. Mas lembre-se, você ainda está em risco de perda de dados. Então, primeiro faça backup dos dados e tente fazer esse tipo de tarefa.