Tem certeza de que só permite usar um disco?
Ele pede um disco raiz para instalar o gerenciador de inicialização. Você deve selecionar o disco menor e selecionar o particionamento manual. Leia o manual para etiqueta de disco ou, se você sabe o que está fazendo, o instalador ajuda.
Depois de configurar esse disco, outros discos devem ser oferecidos para configuração em uma lista. Digite o nome do disco correto e siga para disklabel e adicione as partições restantes naquele disco.
Eu só usei o emulado VAX em simh, mas duvido que exista alguma diferença, desde que ambos os discos sejam realmente detectados corretamente.