Não tenho certeza de qual termite você recebe mais de gnome-terminal . termite tem um "modo de seleção", mas se você estiver executando tmux dentro de termite , então tmux já tem um modo de seleção semelhante que você pode usar. Se você quiser lançar um shell diferente além de bash dentro do Tmux, veja a opção de configuração Tmux default-shell .
O resultado de pesquisa número um para térmite do tmux é sobre o problema que eles têm trabalhando juntos.
A solução prática aqui parece ser remover termite da equação.