Você precisa colocar na lista de permissões os aplicativos se quiser permitir que eles acessem a bandeja do sistema.
Primeiramente, instale as ferramentas dconf do centro de software (ou por clicando aqui )
Em seguida, pressione Alt + F2 e digite dconf-editor
e execute-o.
AgoranavegueatéoGoogleDesktop->Unidade->Painel.
Agora, altere o valor da lista de permissões de systray para
['JavaEmbeddedFrame', 'Mumble', 'Wine', 'Skype', 'hp-systray', 'scp-dbus-service', 'Pidgin']