Acho que tive o mesmo problema, isso me ajudou:
id=$(xinput --list --id-only 'SynPS/2 Synaptics TouchPad')
xinput --set-prop $id 'Synaptics Edge Scrolling' 0 0 1
Estou usando o Ubuntu 16.04 LTS no ThinkPad T440s e desde a última atualização (que também foi a primeira depois de instalar esta versão), estou experimentando "jump-to-up" irritante quando tento rolar com dois dedos no touchpad (eu não tenho um mouse, então eu não tentei com o mouse). Explicou exatamente, acontece quando eu rolar para baixo, remover meus 2 dedos e colocá-lo novamente em cima do touchpad para rolar para baixo ainda mais, então rolar para cima ou apenas uma página para cima! Eu pensei primeiro é um problema de cromo (porque ao mesmo tempo é atualizado para a versão 51.0.2704.84) então eu reconheci que isso acontece fora do chrome também ... Acontece apenas algumas vezes e outras vezes tudo fica tranquilo)! Eu procurei um pouco e não encontrei nada semelhante a isso ... então eu tento perguntar aqui antes de relatar isso como um bug.
Acho que tive o mesmo problema, isso me ajudou:
id=$(xinput --list --id-only 'SynPS/2 Synaptics TouchPad')
xinput --set-prop $id 'Synaptics Edge Scrolling' 0 0 1
Tive o mesmo problema. Minha solução foi instalar o xserver-xorg-input-libinput e remover a configuração sináptica relevante:
sudo apt install xserver-xorg-input-libinput
sudo mv /etc/X11/xorg.conf.d/99-synaptics-t440s.conf /etc/X11/xorg.conf.d/99-synaptics-t440s.conf.backup