Você presumivelmente tem o Grub instalado no disco rígido, mas seu BIOS está configurado para inicializar a partir do SSD. Diga ao seu BIOS para inicializar a partir do disco rígido ou instale o Grub no SSD.
Minha recomendação é alterar a configuração do BIOS; Dessa forma, cada sistema operacional vive de forma totalmente independente em seu próprio disco. Em particular, você ainda poderá inicializar o Windows se o disco rígido falhar. Mas se você deseja instalar o Grub no SSD, use um liveCD para inicializar em sua instalação do Linux e execute sudo grub-install /dev/sda
ou sudo grub-install /dev/sdb
, escolha qual sda
ou sdb
é o SSD (execute o comando df
para ver em quais discos cada sistema operacional está localizado).