Xterm.
Se você deseja copiar para a área de transferência em vez de para a seleção principal, defina o recurso selectToClipboard como true. No seu ~/.Xresources :
XTerm.vt100.selectToClipboard: true
Se você tiver um mouse sem um botão do meio, pressionar os dois botões ao mesmo tempo emulará um clique do meio na maioria das configurações.
Você pode usar xsel ou xclip para transferir entre as seleções:
xsel | xsel -b # PRIMARY -> CLIPBOARD
xsel -b | xsel # CLIPBOARD -> PRIMARY