Eu tenho um problema parecido com o de this pergunta ..
Estou no Ubuntu 16.04 LTS e normalmente instalo atualizações do sistema quando elas estão disponíveis. Ontem notei que quando clico em shutdown , o computador mostra a caixa de diálogo Logout and Lock pouco antes de sair AUTOMATICAMENTE em vez de desligar . Eu tenho que executar o comando de desligamento no terminal para realmente desligar meu computador. O link acima não me ajudou. Espero que você possa me entender e resolver o meu problema.