Isso é bem amplo.
O Shell era a interface entre o kernel do usuário e o unix.
Antigamente, o shell seria semelhante ao CLI, ou seja, sh , csh , tcsh eram CLI.
Hoje em dia com a Interface Gráfica do Usuário (filhos do X-window, localizador da apple, ambiente de trabalho da amiga) você pode executar seu host sem knoning sobre ls , portanto, de alguma forma as GUIs também podem ser chamadas de "shell".
No entanto, bash e friend estão no CLI e shell familly, enquanto o Gnome, KDE e todos estão no GUI familly.