Se bem entendi, os caras do gnome introduziram uma macro m4 nas versões recentes de glib - GLIB_GSETTINGS e distribuem com glib sources - aqui está em gsettings.m4 : AC_DEFUN([GLIB_GSETTINGS]... .
Seu pacote de interesse, gnome-extensions faz uso desta macro na linha 19 do configure.ac e tenta procurá-lo nos locais padrão do sistema. Provavelmente, você não tem fontes simplificadas instaladas, por isso não pode encontrá-lo.
No Debian, gsettings.m4 vem em libglib2.0-dev package e é armazenado em /usr/share/aclocal/gsettings.m4 . Instale o pacote dev e construa novamente.