Assumindo por "nativo" você quer dizer "comumente instalado com o sistema básico", então não, não existe uma ferramenta específica para isso, mas é fácil criar um script próprio.
#!/bin/sh
for f in "$@"; do
b=$(basename "$f")
# Grab any numeric suffix
n=${b##*[!0-9]}
# Default to 0 if there is no suffix
case n in *[!0-9]* | '' ) n=0;; esac
e=$(expr $n + 1)
cp "$f" "${b%$n}$e"
done
Espero que isso funcione em qualquer shell POSIX razoavelmente recente.