Eu acho que é bastante óbvio - converter seus dados para o formato aceito pelo programa que você gostaria de usar (idéia de que o programa deveria de alguma forma ler o seu formato personalizado é, ekhem, ingênuo?).
No meu código eu gero um arquivo .dat que é do formato:
x \t y \t z \t charge \t type \t ID
Existem cerca de 3000 linhas no arquivo e quero exibir a esfera (de raio 1 em minhas unidades). Eu tentei usar paraview , pymol e rasmol . Paraview não entende meu formato de arquivo. Com o pymol e o rasmol, não consegui entender como eles carregavam meus dados. Algum de vocês sabe como carregar dados que não estão no formato pdb em pymol ou rasmol? Além disso, eu quero colorir as contas de acordo com as 3 últimas propriedades. Existe alguma outra maneira?
Devo observar que preciso da capacidade de navegar pela imagem 3d que recebo.
A minha pergunta pode não estar clara, por isso, peça-me qualquer esclarecimento que eu possa dar.