Soluções simples e fáceis de usar:
- Dropbox + TrueCrypt (trocas do Dropbox diffs binários, por isso tem apenas um pouco de sobrecarga de transferência).
- SpiderOak
- Wuala
Enquanto houver outras soluções, você pode configurar o que preferir: nfs, ftp etc etc e criar facilmente um túnel criptografado com socat [1].