Eu nunca tentei com o CentOS (ou qualquer servidor), mas com outros sistemas, usei o xmodmap. Isso provavelmente só funciona com xwindows em execução, mas não tenho certeza.
Usando o xev, você pode encontrar os códigos de teclado para várias teclas. Eu acredito que 66 é a tecla caps lock.
Então, em um terminal, digite estas linhas:
xmodmap -e 'keycode 66 = Control_L'
xmodmap -e 'clear Lock'
xmodmap -e 'add Control = Control_L'
Teste-o para ver se funciona bem e digite:
xmodmap -pke >~/.Xmodmap
Agora, sempre que você digitar xmodmap .Xmodmap, ele irá remapear as chaves. Para não fazer isso em todas as reinicializações, adicione uma linha ~ / .xinitrc, assim:
xmodmap .Xmodmap
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