Eu segui estas instruções do It's FOSS para usar bcdedit em um prompt de comando admin-priveledged, mas com um caminho um pouco diferente, já que era o Fedora em vez do Ubuntu:
bcdedit /set {bootmgr} path \EFI\fedora\grubx64.efi
Na próxima reinicialização, cheguei ao GRUB, o que me permitiu inicializar no Fedora ou no Windows.
EDIT : A mesma solução também funcionou depois que o GRUB foi ignorado após a atualização do BIOS da minha máquina.