Você precisa criar um usuário e adicionar esse usuário ao sudo. Dependendo do sabor do Linux, você adicionará automaticamente o usuário ao sudo. Se você receber algo como este usuário não está na lista de sudeoers, apenas google, você deve ser capaz de resolvê-lo. Sua melhor prática para usar um usuário e sudo. Sudo basicamente significa fazer algo como um usuário normal com permissões de root.
Por exemplo, para instalar o problema php ou mysql:
No Ubuntu sudo apt-get instalar lamp-server ^ (isso instalará todos os pacotes de software relacionados a lâmpadas, pedir-lhe para configurar o servidor mysql) tudo em um tiro
No Redhat / Fedora / Centos sudo yum instala o php5, isto e aquilo
Dessa forma, quando você precisar alterar o comportamento do software, precisará apenas suotar alguma coisa, para algo, se souber o que quero dizer.