Instale smartmontools (sudo apt-get install smartmontools), depois verifique a integridade do disco com:
$ sudo smartctl -a /dev/sdb
Examine a saída, poste aqui se quiser. Você também deve executar um teste offline estendido:
$ sudo smartctl -t long /dev/sdb
Aguarde a conclusão e verifique os resultados, provavelmente a sua unidade está falhando e você precisa substituí-la.