Isso foi corrigido após algumas atualizações. Eu também já atualizei para o Fedora 25 e não estou encontrando o problema.
No Fedora 24, após cada atualização do kernel, a versão de depuração do kernel mais recente está no topo da lista de kernels durante a inicialização.
A execução de grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg
corrige a lista, mas atualmente tenho que executá-la após cada atualização.
Existe uma maneira de corrigir isso de forma que a lista seja ordenada corretamente após cada atualização do kernel?