dd é seu amigo.
Exemplo de sintaxe:
dd if=/dev/sda1 of=/dev/sdb1 bs=1M
Como alternativa, você pode colocar a partição em um arquivo e o arquivo dd em seu disco de destino em um deslocamento diferente.
Para mais informações, digite man dd
em um console para descobrir os vários usos e opções.
Edite, modifique o exemplo para mostrar como copiar uma partição.