Você pode usar xdotool
para conseguir o que deseja. A página principal do projeto termina no github. Você poderia fazer algo assim, por exemplo:
xdotool behave_screen_edge bottom-left search --class gnome-terminal windowactivate
Isso lhe dará um canto quente no canto inferior esquerdo que ativará todas as janelas que são membros do terminal gnome da classe. Este é, de longe, o método mais fácil que vi para realizar coisas como essa no X.
xdotool
é bastante fácil de usar e parece estar na maioria dos repositórios das principais distribuições. Você pode conferir a página man também. Existem vários exemplos para você começar lá junto com alguns scripts de exemplo sob o repositório do github.