Isso prova mais uma vez que, se você executar scripts aleatórios fora da Internet, perderá.
Quem escreveu esse tutorial? Mais importante, quem escreveu essa coisa "iRedMail"? (nunca ouvi falar disso). Você revisou o roteiro para ter certeza de que ele não fez nada errado?
No melhor dos casos, esse script (eu não o revisei) simplesmente tem um bug que o levou a definir permissões em uma variável vazia que ele preenche com um "/". Na pior das hipóteses, seu servidor agora está empenhado e você deve reinstalá-lo.