Você quer dizer que deseja remover a restrição noexec
de um diretório em / home sem removê-lo da partição inteira? Se assim for, ligue a montagem do diretório e remontá-lo com opções padrão pode funcionar. Mas por favor conduza seus próprios testes. Abaixo está um hack sujo que parecia funcionar usando EXT4, mas provavelmente seria mais limpo / seguro / melhor se você pudesse vincular a montagem do diretório webapp em algum lugar além de si mesmo. Isso deve ser executado em um script de shell, depois que as montagens do fstab forem concluídas:
mount --bind /home/user/webapp /home/user/webapp
mount /home/user/webapp -oremount,defaults