Não, em geral, você não pode montar um subdiretório de um sistema de arquivos, a menos que esse sistema de arquivos o suporte especificamente.
Às vezes, o suporte à montagem de subdiretório é encontrado em sistemas de arquivos de rede, como NFS ou SMB, onde é possível montar um subdiretório de um sistema de arquivos exportado.
O BTRFS tem a opção subvol
, mas isso é específico do sistema de arquivos.