Você não pode usar a substituição de parâmetro do shell dentro de um programa awk .
Para remover o primeiro bit da sexta coluna, use sub() :
bjobs -w | awk 'NR > 1 { sub("^[^*]*[*]", "", $6); print $1, $6 }'
Isso modificaria o sexto campo removendo o bit até o * antes de imprimi-lo. A expressão regular ^[^*]*[*] corresponde a qualquer número de caracteres que não sejam * no início da cadeia e, em seguida, * . Isso é então substituído pela string vazia.
O acima transforma a saída da pergunta em
821213 pirineus
823954 pirineus4
824083 collserola2
824297 collserola10
824305 collserola5
NOTA: Todas as variações abaixo (incluindo a sed solution) assumem que existe um * no sexto campo . O acima funcionaria mesmo se não houvesse.
Outra maneira de fazer isso é dividir o sexto campo no * e imprimir a segunda parte:
bjobs -w | awk 'NR > 1 { split($6, a, "[*]"); print $1, a[2] }'
Uma terceira maneira de fazer isso é usar os dois espaços em branco e * como o delimitador de campo (observe a alteração no número do campo):
bjobs -w | awk -F "[[:blank:]*]+" 'NR > 1 { print $1, $7 }'
Usando sed :
bjobs -w | sed -nE 's/^([[:alnum:]]+).*\*([[:alnum:]]+).*/ /p'