Não. Você acaba com usuários cujo grupo de login não tem nome.
Eu uso o Ubuntu 14.04 e fiz 120 usuários. 115 usuários estão em "estudante" e 5 usuários estão em "assistente".
Se eu excluir grupos, os usuários desses grupos também serão excluídos?
Não. Você acaba com usuários cujo grupo de login não tem nome.
Você não pode remover o grupo principal de nenhum usuário existente. Você deve remover o usuário antes de remover o grupo. (veja a documentação do gropudel)
Não, desde que o usuário tenha um grupo principal diferente de "aluno" ou "assistente", eles poderão ser excluídos facilmente. No entanto, se esses grupos forem os principais usuários, você não poderá excluí-los sem dando aos usuários um novo grupo primário.