Alterando o sinal (+ ou -) de um número com base em colunas não correspondentes

Question

Estou tendo um problema com um script do awk que provavelmente deve ser bem simples.

Eu tenho arquivos que se parecem com isso, que têm milhares de linhas, com colunas 2 e 3 consistindo de G, C, T e A; e 4,5,6 numéricos (apenas a coluna 4 tem valores negativos):

ID A1 A2  BETA  SE     P
1  A  T   0.01  0.001  0.2
2  G  G   0.02  0.003  0.4
3  C  T  -0.02  0.005  0.1
4  T  T  -0.01  0.006  0.2

O que pretendo fazer é alterar o sinal do número (positivo para negativo e vice-versa) na coluna 4, se as colunas 2 e 3 não corresponderem. Então, o resultado deve ser assim:

ID A1 A2  BETA  SE     P
1  A  T  -0.01  0.001  0.2
2  G  G   0.02  0.003  0.4
3  C  T   0.02  0.005  0.1
4  T  T  -0.01  0.006  0.2

Minha tentativa de fazer isso é com o awk:

awk '{if($2 != $3 print $0}'

O que percebo não é um grande começo para um problema simples, mas não consigo descobrir como alterar + para - e vice-versa de uma só vez.

Uma solução seria ótima, com passos sobre como funciona ainda melhor!

    

Answer 1

Use awk :

awk 'NR!=1&&$2!=$3{$4=$4*-1};1' file

• Se a condição $2!=$3 for verdadeira e não for a primeira linha ( NR!=1 ), multiplique o valor de $4 por -1 .

Se você quiser colunas fixas, use novamente column :

awk 'NR!=1&&$2!=$3{$4=$4*-1};1' file | column -t

• O -t sinalizador de column determina o número da coluna e cria uma tabela.

Saída:

ID  A1  A2  BETA   SE     P
1   A   T   -0.01  0.001  0.2
2   G   G   0.02   0.003  0.4
3   C   T   0.02   0.005  0.1
4   T   T   -0.01  0.006  0.2