Basta ligar para useradd e passar os argumentos desejados. Para criar um usuário do sistema, passa a opção -r . Se você não quiser um diretório inicial, escolha algo como /none e passe a opção -M . Se você quiser usar su para executar comandos como esse usuário, o usuário precisa ter um shell válido.
useradd -r -d /none -M -U -s /bin/sh
Eu não recomendo modificar o arquivo passwd manualmente. Você corre o risco de cometer um erro de sintaxe ou excluir acidentalmente algo importante. Se você precisar editar passwd , chame vipw , que protege contra modificações simultâneas.