É mais fácil se você usar entrar :
$ join -t, -a 1 -a 2 -j 1 -e ' NA' -o auto file1 file2
123, 234, abc
345, 789, dnc
678, 900, NA
Arquivo 1:
123, 234
345, 789
678, 900
Arquivo 2
123, abc
345, dnc
Saída desejada (todas as colunas no arquivo1 e valor ausente no arquivo dois como NA):
123,234,abc
345,789,dnc
678,900,NA
É mais fácil se você usar entrar :
$ join -t, -a 1 -a 2 -j 1 -e ' NA' -o auto file1 file2
123, 234, abc
345, 789, dnc
678, 900, NA
awk -F ", ?" -v OFS=, 'FNR == NR { a[$1]=$2;next; };
{ if ($1 in a) print $1,$2,a[$1]; else print $1,$2,"NA"; }' file2 file1
awk
awk 'BEGIN{OFS=""}NR==FNR{a[$1]=$2;};NR>FNR{if($1 in a){print $0,", ",a[$1];}else{print $0,", NA";}}' file2 file1 > tmp
a saída será armazenada em tmp, como você pediu para atualizar do arquivo3
awk 'BEGIN{OFS=""}NR==FNR{a[$1]=$2;};NR>FNR{if($1 in a){print $0,", ",a[$1];}else{print $0,", NA";}}' file3 tmp
saída:
123, 234, abc, 2014/10/20
345, 789, dnc, NA
678, 900, NA, 2013/02/30
Tags text-processing awk join