Use o gerenciador de pacotes da sua distro e verifique o pacote para ver se o arquivo é original. Por exemplo, na minha distro baseada em rpm, posso fazer o seguinte:
# Find the full path to the file
$ locate mod_dav_svn.so
/usr/lib/apache/mod_dav_svn.so
# Find out what package it belongs to
$ rpm -qf /usr/lib/apache/mod_dav_svn.so
apache-mod_dav_svn-1.6.16-1.i686
# Verify that package to make sure the file hasn't been tampered with
$ rpm -vV apache-mod_dav_svn
........ /usr/lib/apache/mod_dav_svn.so
Os pontos indicam que todos os testes são normais para esse arquivo. Se tivesse sido alterado, poderia ter indicado uma incompatibilidade de soma de verificação, uma alteração de data, uma alteração de tamanho, etc.