Parece (a partir do seu prompt) que o arquivo está localizado no directoryx correto, mas como md5sum tentará ler o arquivo no caminho dado pelo arquivo .md5 , e já que você está em directoryx , não encontrará.
Mova um nível para cima na hierarquia de diretórios e use
$ md5sum -c directoryx/file1.txt.md5