Você precisa tentar concluir essa atualização.
Se você tiver o Live CD / DVD / USB inicializado, tente {blkid | mais} para listar todos os seus {UUID = xxxxxxxx.xxxxxxxxxxx.xxxxxxxx.xxxxxxxx} números. É estranho que a atualização mexe os dados. Veja se o valor UUID corresponde ao anterior (deveria).
Em seguida, conecte-se à Internet e tente {chroot} entrar no Debian danificado e faça com que a atualização reinicie e desta vez fique atento ao que você está fazendo.
Seu problema será corrigido quando:
1) Você reinicia a atualização e a completa corretamente.
2) Você encontra todos os arquivos que essa atualização alterou e os retorna para seus valores antes de você tentar atualizar (manualmente).