Você pode criar um módulo no arquivo master form que contém os arquivos ant correspondentes. Por exemplo:
Você pode criar um arquivo mestre como
/opt/Makefile
all:
(make module1)
(make module2)
module1:
(cd myApp/module1/; ant -f patch.xml)
module2:
(cd myApp2/module2; ant -buildfile build.xml)
Então você pode executar o Makefile mestre como:
$ make Makefile all