É preferível parar a reprodução de todas as fontes de áudio antes de iniciar o JACK para evitar problemas
Instale o misturador Pulseaudio padrão pavucontrol - muitos controles de painel e mixers para Pulseaudio não mostram todas as opções disponíveis, particularmente as opções de roteamento de dispositivos de som.
Os aplicativos com problemas de áudio provavelmente ainda estão tentando ser direcionados ao dispositivo de áudio normalmente usado pelo Pulseaudio. Se o JACK tiver iniciado e tomado o controle do dispositivo de áudio, o pavucontrol terá uma lista suspensa de opções de roteamento para redirecionar o áudio do dispositivo de hardware para o coletor de tomadas Pulseaudio.
O Pulseaudio geralmente precisa apenas ter a reprodução redirecionada manualmente uma vez para cada aplicativo. A alteração de roteamento é salva e o Pulseaudio normalmente será alternado automaticamente no futuro