Eu encontrei uma solução para criar uma estrutura de arquivo fictícia de todos os caminhos de arquivo no meu directoy atual que eu possa procurar depois:
cat find.output | sed -r 's/^\/(.*)$/"\.\/"/' | xargs mkdir
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find.outputé meu arquivo - Eu uso
sedpara tornar os caminhos absolutos relativos e citá-los (caso eles contenham espaços) -
xargsé usado para criar um diretório para cada caminho
No entanto, ficaria feliz com uma solução que não toca no meu sistema de arquivos real.