Um xorg moderno deve escolher todos os arquivos *.conf em /etc/X11/xorg.conf.d/ e usá-los.
O Xorg pode descobrir muito por si só, se você simplesmente soltar um arquivo com a mudança necessária (uma Seção - EndSection ) em /etc/X11/xorg.conf.d/ , o Xorg irá use essa configuração em uma precedência mais alta que os arquivos em /usr/share/X11/ .
Os arquivos em /usr/share/X11/xorg.conf.d/ são reservados para o gerenciador de pacotes. O Xorg irá procurar lá passado . Nunca mude nada lá, o seu gerenciador de pacotes pode sobrescrever suas alterações sem perguntar.