Bem, não seja muito egoísta, mas você estará procurando um utilitário baseado em UNIX que possa fazer clonagem e recuperação bare-metal. A empresa de software que eu trabalho faz exatamente isso e você pode usar o teste gratuito para fazer o seu clone.
Embalará tudo bem e permitirá que você passe de físico para virtual. Basta fazer um backup completo do sistema do Ubuntu, criar um disco de recuperação, anexar o disco de recuperação à sua VM e inicializar.
-Rick