Usando awk
:
awk 'BEGIN{FS=OFS="~";v=1111}{$3-=v; print $3}' file
Isso gera o arquivo modificado para stdout.
A~Test1~8352~testA
B~Test2~3714~testB
Para subtrair valores TIME (formato hhmmss), os seguintes trabalhos (conforme o seu comentário):
entrada:
A~Test1~203000~testA
awk -v dif="014000" '
BEGIN{ FS=OFS="~"
difS=toSec(dif) }
{ f3=""
shoS=toSec($3)-difS
for( per=3600; per>=1; per/=60 ) {
ord=int(shoS/per)
f3=f3 sprintf( "%02s", ord )
shoS-=(ord*per) }
$3=f3
print }
function toSec(x) {
hh=substr(x, 1, 2)
mm=substr(x, length(x)-3, 2)
ss=substr(x, length(x)-1, 2)
return ss+(mm*60)+(hh*3600) }
' file
saída:
A~Test1~185000~testA