Se você estiver usando metadados 1.2 (4K desde o início), talvez haja metadados antigos do sistema de arquivos naqueles 4K que não são usados pelo mdadm. Você poderia zerar esses:
dd bs=4k count=1 if=/dev/zero of=/dev/sde1
E veja se isso se livra da mensagem ofensiva.
No futuro, use wipefs
em uma partição antes de usar essa partição para qualquer outra coisa (mdadm, pvcreate, mkfs, parted, ...).