Para depurar isto, em top selecione f para campos e ative PPID movendo o cursor para lá e pressionando Espaço . Talvez seja necessário desmarcar um dos outros campos ( VIRT ) para que você possa ver esse ID do processo pai.
Usando o PPID você deve ser capaz de dizer qual programa invocou aquele shell, provavelmente é o PID do seu programa, e você está realmente olhando para um subshell em top .