Às vezes sinto o mesmo problema. Eu suspeito que isso esteja relacionado ao modo de suspensão. Eu percebo que este é um tópico antigo, mas googling me trouxe até aqui, então pode ajudar alguém.
De qualquer forma, para curar o sintoma:
- Reinicie o gnome-settings-daemon. É provavelmente o suficiente para matá-lo, e deixe renascer.
Nenhuma reinicialização é necessária.