Todas as implementações do cron que eu conheço relocam /etc/crontab
a cada minuto, ou seja, com a mesma frequência com que executam jobs. Portanto, as tarefas agendadas “reais” são aquelas no arquivo crontab.
Existem (ou foram) algumas implementações com bugs do cron que verificam se os jobs serão executados primeiro e somente depois verificar os crontabs. Isso causa um atraso de um minuto entre configurar os trabalhos e executá-los. Eu não acho que nenhuma das implementações atuais do cron no Linux (existem várias) sejam afetadas.