Eu tive um problema semelhante.
sudo certbot certonly --dns-route53 -d example.com
An unexpected error occurred:
VersionConflict: (botocore 1.10.58 (/usr/lib/python2.7/site-packages),
Requirement.parse('botocore>=1.6.0,<1.7.0'))
Sua postagem me ajudou a encontrar o link que aconselhava o uso do pip botocore boto3 & & pip instale o boto3 para resolver o problema.
sudo pip uninstall botocore boto3 && sudo pip install boto3
Resolvi o problema no meu dispositivo.