1) Você pode fazer isso, mas apenas no Deja Dup 24 ou superior. O que significa usar o Ubuntu 12.10 ou superior. Não há backport para 12.04 LTS agora.
Para que o Deja Dup 24 sempre faça backups completos, execute o seguinte:
gsettings set org.gnome.DejaDup full-backup-period 1
2) Não! : - /