O tipo de solução para o problema é recompilar o Torque sem suporte a GPU e a criação de pacotes de clientes. Em seguida, pacotes de clientes recém-criados (que não suportam GPU) podem ser instalados nos nós nos quais você deseja desativar as GPUs.
Uma das desvantagens dessa abordagem é que você não pode selecionar quais GPUs estão desativadas. Você pode desativar todos eles ou nenhum. A segunda desvantagem óbvia é que você tem que fazer isso em cada nó separadamente. Não é grande problema se você tiver apenas vários nós ou se estiver usando algum tipo de software de gerenciamento. Na minha opinião, o problema é que é errado do ponto de vista conceitual.