Eu acho que você não pode adicionar alguma variável ENV no arquivo Desktop, mas pode conseguir o que deseja criando o mesmo arquivo da área de trabalho no diretório pessoal de todos os usuários.
O caminho é como:
~/.local/share/applications/
Esses arquivos da área de trabalho são específicos do usuário. Você também pode adicionar diretórios de área de trabalho, se desejar.