Não sei se está relacionado ao fluxbox, mas sempre que inicio o gerenciamento de transparência na inicialização com xcompmgr -f , fica difícil usar janelas pop-up. Todos eles são enviados para o segundo plano e as janelas principais do aplicativo permanecem no topo.
É bastante inutilizável com aplicativos que usam muito as janelas pop-up. Se eu não iniciar o xcompmgr, o comportamento da janela é ok.
Alguma ideia do que verificar ou fazer?