Não, você não pode encurtar o lado esquerdo da comparação. Você pode, no entanto, usar um padrão no lado direito:
[[ iotools == @("$VAR"|"$VAR_2") ]]
Observe que você precisa usar [[ ... ]]
em vez de [ ... ]
para que isso funcione. Veja Pattern Matching em man bash
para detalhes.
As variáveis devem ser citadas para evitar que VAR='a|iotools|b'
corresponda.