com perl
:
perl -ne 'printf "%s %-20s %s\n", /(\S+\s+)(\S+)\s*(.*)/' your-file
Ou para evitar tocar nas linhas que não correspondem a esse padrão:
perl -pe '$_ = sprintf "%s %-20s %s\n", $1, $2, $3
if /(\S+\s+)(\S+)\s*(.*)/' your-file