Talvez não seja exatamente o que você quer, mas você pode clicar com o botão direito do mouse no ícone do lançador do Gedit e escolher Bloquear para o Launcher . Agora o Gedit permanecerá lá, não importa se você o usa atualmente ou não.
Eu atualizei de 12.04 para 12.10, e quando eu minimizo o gedit, ele não aparece na barra de ativação. A única maneira de recuperá-lo é abrir um dos arquivos que já foram abertos no gedit.
Talvez não seja exatamente o que você quer, mas você pode clicar com o botão direito do mouse no ícone do lançador do Gedit e escolher Bloquear para o Launcher . Agora o Gedit permanecerá lá, não importa se você o usa atualmente ou não.