Como eu tenho certeza que você sabe, o Ubuntu é baseado no Debian (versões do Ubuntu são rebaseadas periodicamente com testes Debian) e há muita semelhança entre os dois. Dito isso, elas diferem de maneiras, por vezes, bastante significativas. Por exemplo, por muitos anos o Ubuntu usou upstart como seu sistema init padrão, enquanto o Debian ficou com sysvinit (ambos usam systemd como padrão agora).
Em geral, muito do wiki do Ubuntu deve ainda ser aplicável ao Debian. Se você está seguindo as instruções de configuração (e isso se aplica a qualquer livro de receitas ou HOWTO que você siga), você deve validá-las antes de usá-las. Pode haver sutilezas nos comandos entre os lançamentos de software, etc., e digitar comandos a qualquer momento pode deixar você com um sistema muito quebrado.